近日，国际知名杂志Emerging Microbes & Infections（IF=19.568）发表了畜牧兽医所联合山东第一医科大学等单位合作研究成果：Identification of a recombinant equine coronavirus in donkey, China。该研究首次在我国驴群中发现马冠状病毒（ECoV），研究人员获得了病毒全基因组序列并进行了生物信息学分析，为ECoV跨宿主感染驴和在马属动物中监测ECoV提供了证据及理论依据。畜牧兽医所为第一产权单位，草食动物疫病防控创新团队齐鹏飞为第一作者，张伟和山东第一医科大学史卫峰为本文共同通讯作者。
ECoV和SARS-CoV、SARS-CoV-2、MERS-CoV均是β冠状病毒属成员，其中ECoV属于Embecovirus亚属。本研究基于RT-qPCR从两例腹泻驴驹的小肠样本中检测出ECoV，通过细胞培养及电镜观察发现样本中存在典型的CoV病毒颗粒（图1）。研究人员对两例阳性样本进行高通量测序，通过序列组装和比对获得了两条ECoV全基因组序列。序列分析表明，新发现的两株ECoV基因组序列完全一致，与数据库中的ECoV比对发现相似性最高的是ECoV NC99（图2）。对ECoV新毒株和代表毒株进行系统发育分析表明，尽管新毒株和已知ECoV位于同一个大的分支，但又存在明显的区分（图3）。进一步的重组分析发现该毒株NS2基因附近存在重组现象，推测为新型重组突变株，这是我国科研人员首次在国内驴群中发现分离鉴定出ECoV。该研究得到山东省现代农业产业技术体系、山东省农业科学院创新工程和山东第一医科大学学术提升计划等项目的资助。
（文章链接：https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/22221751.2022.2056522）
