近日,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所牛遗传育种科技创新团队利用牛胎儿骨骼肌成肌分化体外模型,揭示了牛骨骼肌发育过程中的染色质可及性和转录动态调控模式。相关研究成果发表在《细胞增殖(Cell Proliferation)》(IF=6.831)上。
骨骼肌的生长发育直接影响肉牛生长速度和肉质,胎儿期骨骼肌的发育对肉牛后天生长发育有重要且长期的影响。然而,当前对于肉牛骨骼肌生长发育这一重要性状的基因组表观调控机制仍不清楚。
研究人员利用牛胎儿骨骼肌分离、纯化出成肌细胞并诱导分化,利用ATAC-seq和RNA-seq技术获得了成肌细胞增殖分化全过程的染色质可及性和基因表达信息。分析发现,牛成肌细胞体外增殖和分化过程中染色质可及性和基因表达呈现动态变化。研究还鉴定出阶段特异性基因和染色质可及性区域,揭示了参与牛成肌细胞增殖和分化的关键基因、转录因子及信号通路的时序性调控模式。整合转录组和GWAS结果,从基因组、表观组及转录组多个层面探究了牛重要经济性状基因组调控位点与基因组染色质开放区的关系。
该研究得到了中国农业科学院创新工程、国家肉牛牦牛产业技术体系、国家自然科学基金等项目的资助。李倩和王亚慧为论文共同第一作者,李俊雅研究员和张路培研究员为通讯作者。
原文链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/cpr.13219