近日,基因中心联合南开大学生命科学学院高山副教授等学者在国际著名期刊《Frontiers in Microbiology》(IF=5.640)发表题为“Full-Length Genome of an Ogataea polymorphaStrain CBS4732 ura3Δ Reveals Large Duplicated Segments in Subtelomeric Regionsteins”的文章(原文链接:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2022.855666/full?&utm_source=Email_to_authors_&utm_medium=Email&utm_content=T1_11.5e1_author&utm_campaign=Email_publication&field=&journalName=Frontiers_in_Microbiology&id=855666)。基因中心贝锦龙副研究员为论文的共同第一作者。
汉逊酵母(Ogataea polymorpha)是产业化应用最广泛的生物反应器之一,CBS4732、NCYC495与DL-1是三种应用最普遍与研究最多的汉逊酵母菌株。基于CBS4732营养缺陷型菌株,南开大学汪和睦教授曾开发了第一个全国产化的乙肝疫苗,但由于长期以来缺乏高质量的全基因组数据,学界对三者之间的进化关系存在很大争议。
基因中心微生物资源室副主任贝锦龙博士长期深耕于甲醇酵母产业化应用领域,近年与南开大学合作,通过对营养缺陷型CBS4732 ura3Δ菌株的高通量深度测序,得到了含有准确端粒信息的完整全长基因组。鉴定发现,CBS4732与NCYC495菌株同属一个种,且系统发育非常接近,因此基于两种菌株的基础研究成果和已开发产品可以完全合并。这为进一步深化汉逊酵母产业化应用,提供了坚实的理论基础,同时,也在国际上首次报道了酵母亚端粒区存在长度达2.7万bp以上的接近100%同一度的重复大片段。此前,“亚端粒区大片段扩增是酵母基因组扩张主因”这一科学假说存在较大争议,本发现为证实该假说的真实性提供了证据。