近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所提出线粒体基因组组装新策略,发表了7个高质量的高粱细胞器基因组,揭示了高粱线粒体基因组构象之间的差异与高粱驯化历史的关系。相关研究成果发表在《BMC植物生物学(BMC Plant Biology)》上。
由于复杂的结构变化和长段的重复性DNA,高粱的细胞器基因组组装十分困难,为解决这一问题,科研人员利用线粒体基因组构象提出了新型组装策略,该方法将七种不同的高粱基因组分为三种类型,通过比较基因组学方法,发现栽培高粱在东非和西非的两次独立驯化事件均与线粒体基因组结构类型相关联。科研人员进一步研究发现,这些转移序列在不同材料的染色体区域间的富集模式不同,这为了解细胞器转移序列在细胞核内的进化以及栽培高粱驯化历史提供了理论依据和新思路。
该研究得到深圳市优秀科技创新人才培养-优秀青年基础研究,国家自然科学基金,中国农业科学院“青年英才计划”等项目支持。
原文链接:https://doi.org/10.1186/s12870-023-04104-2