水产种业是水产行业发展的重要基础和核心命脉，水产种业科技创新牢固支撑了我国水产养殖业的大国地位。为推进渔业高质量发展，有效加强种业创新攻关，发掘优异基因资源，研发先进育种技术，创制优异种质，培育突破性新品种，水科院于2021年启动种业创新攻关计划，设立强种工程、培优工程和赶超工程，珠江所有6个物种列入计划，其中草鱼列为培优工程。围绕草鱼速生与低脂型优新品系培育开展了系列研究工作，取得了重要进展。
一是在原有长江、珠江流域等10个不同地理来源草鱼种群基础上，进一步系统调查了湖北、湖南、江苏、江西、浙江、河北、陕西、广东等8个省份的养殖或野生种质资源，扩充了种质资源库；建立草鱼种质资源的遗传分析方法，分析了不同群体的遗传结构和群体间的亲缘关系。
二是通过比较测定不同地理种群后代的生长性能和不同种群间杂交子代生长性能，获得3个在生长性状上有明显优势的地理种群和2个杂交优势组合；据草鱼成鱼个体大、性成熟周期长、选育和繁殖场地设施要求高等特点，确定和实施了以BLUP家系选育为主，结合分子标记辅助育种技术、雌核发育技术进行综合选育的方案；开发出避免草鱼近亲繁殖的微卫星标记技术和操作软件；挖掘出一批与生长性状相关的分子标记。
三是以速生为主要目标性状，开展新品种（系）选育工作。采用家系选育策略，基于BLUP法估计体重性状育种值，选留后备亲鱼近千尾。2021年完成F3代苗种繁育，F3代选育家系生长优势显著，生长速度提高29.2%。
四是以“低脂-型优”为目标性征开展新品种（系）选育工作，在速生选育工作的基础上，利用快长选育系F2代性成熟亲本，以腹脂率和矢状面体型为性状评价指标，采用后裔测定与家系选择，开展“低脂-型优”草鱼新品系培育，目前已获得稳定的“低脂-型优”F3代选育家系；经15个月养殖，草鱼速生选育系F3代比非选育群体长速提高20%以上，体型修长，选育效果显著。
五是创建基于速生F3代品系优质种苗、科学免疫和科学足量投喂优质饲料为一体的生态高效健康养殖模式，通过投放优质种苗、科学免疫、定期生态及水质调控、科学管理（强烈增氧、强保健、强投喂）等系列措施实现了全程不消毒、不杀虫，草鱼养殖成果率达到了90%以上，亩产万斤。
